Şi în ceea ce priveşte originea Merengue-lui părerile sunt împărţite.
Potrivit lui Jean Fouchard, „Merengue” a evoluat din fuziunea muzicii sclavilor, cum ar fi Chica şi Calenda, cu Contradanse-ul, iar numele de Merengue a derivat din Mouringue, muzica populaţiei Bantu din Madagascar numită „Bara”.
Flérida de Nolasco, îi atribuie paternitatea primelor compoziţii de Merengue „¡Ay, Coco!”, „El sancocho”, „El que no tiene dos pesos no baila”, and „Huye Marcos Rojas que te coje la pelota” colonelului Juan Alfonseca Baptiste (1810-1875).
Rafael Vidal susţine că apariţia acestui gen muzical reprezintă expresia spontană a bucuriei provocate de victoria împotriva haitienilor în bătălia de la Talanquera din 1844.
Conform altei variante, Merengue a apărut cu ocazia unei petreceri, dată în onoarea unui oaspete de rang înalt invalid de un picior. Când acesta a început să danseze, toţi invitaţii au remarcat felul special în care acesta se mişca datorită handicapului său şi ca o dovadă de respect, toată lumea s-a simţit obligată să-l imite. Şi astfel s-ar fi născut Merengue-ul.
Cea de-a patra variantă susţine că Merengue își are originea în tradiţiile africane Taino, care mai târziu s-au amestecat cu elemente coloniale spaniole şi africane. Nu se ştie însă dacă dansul a venit direct din Africa sau a trecut şi prin Cuba.
Unii sugerează chiar o legătură cu piraţii din „La Tortuga”, deoarece mulţi dintre aceştia (prin natura profesiei) suferiseră amputări ale membrelor inferioare şi purtau proteze de lemn. Acest lucru îşi punea amprenta asupra manierei de locomoţie şi implicit asupra dansului lor.
Alții susţin că dansul a apărut datorită sclavilor care, legaţi cu lanţuri de picioare la comun, erau forţati să-şi târască piciorul încătuşat, sincronizându-se pe bătaia tobelor când recoltau trestia de zahăr.
De asemenea, este posibil ca numele să fi fost împrumutat de la prăjitura haitiană, făcută din albuş de ou şi zahăr, numită Meringue.
Jean Fouchard susţine că numele de Merengue a derivat din Mouringue, muzica populaţiei Bantu din Madagascar numită „Bara”.